公共卫生学院是为公共卫生领域培养专门人才的二级教学单位，起始于1960年设立的卫生系，1987年改称为预防医学系，2006年成立公共卫生学院。

我院公共卫生人才培养始于1951年，由当时的沈阳市卫生技术学校为沈阳市卫生局开办卫生干部培训班、统计训练班、妇幼卫生训练班，面向社会青年招生第一期公共卫生训练班。1952年10月，学校更名为沈阳市卫生学校，同年招收公共卫生医士，开始培养具有中专学历的公共卫生人才。

1958年8月，学校更名为沈阳医学专科学校，开设卫生专业，公共卫生人才培养由中专升格为专科教育；1960年9月，设立卫生系。

1963年至学校由专科下马，恢复为沈阳市卫生学校。卫生专业作为沈阳市卫生学校的一个主要专业，受文化大革命影响从1966年至1969年停止招生，1970年开始招收卫生医士专业的工农兵学员。

1977年高考制度恢复，开始招收卫生专业三年制中专学生；1978年3月，沈阳市卫生学校改建为沈阳医学专科学校，恢复设立卫生系，每年招收80名卫生专业专科生。

1987年5月6日，国家教委批准成立沈阳医学院，卫生系改为预防医学系，当年开始面向沈阳市招收预防医学专业本科学生，每年30人。

2006年7月，撤销预防医学系，成立公共卫生学院。